Samudra Manthan की कथा भारतीय पौराणिक कथाओं से उत्पन्न हुई है और इसका वर्णन भागवत पुराण, विष्णु पुराण और महाभारत जैसे ग्रंथों में किया गया है। ये सभी ग्रंथ हिंदू धर्म में दिशासूचक माने जाते हैं। इन ग्रंथों में वर्णन है कि कैसे देवताओं और असुरों ने भगवान विष्णु के मार्गदर्शन में समुद्र मंथन करके अमरता का दिव्य अमृत प्राप्त किया।
प्राचीन काल में हिंदू धर्म कई देशों में फैला और अंगकोर वाट में समुद्र मंथन की कहानी का चित्रण इसका प्रमाण है।
अंगकोर वाट की पूर्वी गैलरी के दक्षिणी भाग में समुद्र मंथन, या सागर मंथन, का प्रसंग दर्शाया गया है। इस नक्काशी में बाईं ओर 88 असुर और शिखाधारी टोप पहने 92 देवता समुद्र मंथन कर उसमें से अमरता का अमृत निकालते हुए दर्शाए गए हैं। दैत्यों ने वासुकि नाग का सिर पकड़ा हुआ है और देवताओं ने उसकी पूँछ। समुद्र के मध्य में, वासुकि मंदरा पर्वत के चारों ओर कुंडली मारे हुए हैं, जो दैत्यों और देवताओं के बीच रस्साकशी में घूमता और जल को मथता है। विशाल कछुए के रूप में अवतरित विष्णु ने मंदरा पर्वत के आधार और धुरी के रूप में अपना कवच धारण किया है। ब्रह्मा, शिव, हनुमान , और लक्ष्मी (धन और समृद्धि की देवी) सभी नक्काशी में चित्रित हैं।
एक बार, देवताओं के राजा इंद्र, हाथी पर सवार होकर, ऋषि दुर्वासा से मिले, जिन्होंने उन्हें एक विशेष माला भेंट की। इंद्र ने माला स्वीकार कर ली, लेकिन उसे हाथी की सूंड पर रख दिया। हाथी उसकी गंध से चिढ़ गया और उसने माला ज़मीन पर फेंक दी। इससे ऋषि क्रोधित हो गए, क्योंकि माला श्री (भाग्य) का निवास थी और उसका सम्मान किया जाना चाहिए था। दुर्वासा मुनि ने इंद्र और सभी देवताओं को शक्ति, ऊर्जा और भाग्य से रहित होने का श्राप दिया। इस घटना के बाद, देवता असुरों से सभी युद्ध हार गए और असुरों ने ब्रह्मांड पर नियंत्रण कर लिया।
देवताओं ने भगवान विष्णु से मदद मांगी, जिन्होंने उन्हें बताया कि अपनी शक्ति वापस पाने का एकमात्र तरीका समुद्र के नीचे स्थित पवित्र अमृत का सेवन करना है। पवित्र अमृत केवल समुद्र मंथन से ही प्राप्त किया जा सकता है। चूँकि देवता शक्तिहीन थे, इसलिए उन्होंने अमरता के अमृत के लिए संयुक्त रूप से समुद्र मंथन करने के लिए असुरों से संपर्क किया। हालाँकि, देवताओं की भगवान विष्णु के साथ पहले से ही यह सहमति थी कि पवित्र अमृत उन्हें सौंप दिया जाएगा।

क्षीरसागर का मंथन एक जटिल प्रक्रिया थी। मंदराचल पर्वत को मथनी की छड़ी बनाया गया और सर्पों के राजा वासुकी को मथनी की रस्सी बनाया गया। इस प्रक्रिया में सहायता के लिए स्वयं भगवान विष्णु को अनेक प्रकार से हस्तक्षेप करना पड़ा। लेकिन जैसे ही क्षीरसागर जल में गया, वह समुद्र की गहराइयों में सरकता रहा। इसे रोकने के लिए, विष्णु ने कच्छप का रूप धारण किया और पर्वत को अपनी पीठ पर धारण कर लिया। कच्छप रूप में विष्णु की यह छवि उनका दूसरा अवतार ‘कूर्म’ था। क्षीरसागर संतुलित होने के बाद, उसे विशाल नाग, वासुकी से बाँध दिया गया और देवताओं और राक्षसों ने उसे दोनों ओर से खींचना शुरू कर दिया। सभी प्रकार की जड़ी-बूटियाँ समुद्र में डाली गईं और समुद्र से अनेक जीव-जंतु और वस्तुएँ उत्पन्न हुईं, जिन्हें बाद में असुरों और देवताओं में बाँट दिया गया।
समुद्र मंथन के दौरान, हलाहल, यानी घातक विष का एक घड़ा भी समुद्र से निकला था। ऐसा माना जाता था कि यह इतना विषैला था कि पूरी सृष्टि का नाश कर सकता था। भगवान शिव ने दूसरों की रक्षा के लिए विष पी लिया। हालाँकि, भगवान शिव की पत्नी पार्वती ने उनकी गर्दन दबा दी ताकि विष उनके पेट में न जाए। इस प्रकार, विष उनके गले में ही रहा, न ऊपर गया और न ही नीचे, और शिव सुरक्षित रहे। विष इतना शक्तिशाली था कि उसने भगवान शिव की गर्दन का रंग नीला कर दिया। इसी कारण, भगवान शिव को नीलकंठ भी कहा जाता है, जहाँ ‘नीला’ का अर्थ नीला और ‘कंठ’ का अर्थ गर्दन है।
मंथन के अंत में, धन्वंतरि (चिकित्सा के देवता) पवित्र अमृत कलश लेकर प्रकट हुए। अमृत निकलते ही, राक्षसों ने उसे बलपूर्वक छीन लिया, जिसके बाद देवताओं और असुरों के बीच युद्ध हुआ।
अंततः, विष्णु ने मोहिनी (नर्तकी) का वेश धारण करके राक्षसों को चकमा दिया और अमृत कलश पुनः प्राप्त कर देवताओं को सौंप दिया। यह कथा भारत में लगभग सभी को ज्ञात है। अंगकोर वाट में समुद्र मंथन की कथा हमारे मन में तत्कालीन साम्राज्यों, प्राचीन काल में भारत और कंबोडिया के संबंधों, विस्तार और आस्था के संघर्ष के बारे में कई प्रश्न उठाती है। और यही कारण है कि अंगकोर वाट और कंबोडिया की यात्रा निश्चित रूप से आवश्यक है।